Οι τροποποιήσεις αφορούν στον Οδηγό Εφαρμογής και στα Παραρτήματα I και XII. Με την 3η τροποποίηση δίνεται παράταση στην προθεσμία της καταληκτικής ημερομηνίας υποβολής της Ηλεκτρονικής Ταυτότητας Κτιρίου και της εξέτασης των «ειδικών περιπτώσεων» αιτήσεων και επίσης γίνεται ενσωμάτωση διευκρινίσεων ως προς την εφαρμογή ειδικότερων διαδικασιών, εννοιών και όρων του Προγράμματος.
Αναλυτικά οι αλλαγές καταγράφονται στην άνω αναφερόμενη Κ.Υ.Α.